临床儿科杂志

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:31-1377/R

国际刊号:1000-3606

临床儿科杂志2021年第7期:转录因子FOXP2 调控先天性巨结肠相关基因表达的生物信息学分析

发布日期:

作者:卢艳娇,崔梦梦,郁雯雯,等

单位:上海交通大学医学院附属新华医院 上海市儿科医学研究所 上海市小儿消化与营养 重点实验室(上海 200092)

关键词:先天性巨结肠; ChEA 3数据库; 转录因子; FOXP2基因,

基金:上海市卫生和计划生育委员会卫生行业临床研究专项(No. 201840014)

目的 鉴定与肠神经系统发育以及先天性巨结肠(HSCR)发生相关的转录因子。方法 运用ChEA3数据库 对调控HSCR易感基因表达的转录因子进行预测以及富集分析,使用GeneMANIA在线工具构建转录因子与靶基因的蛋 白-蛋白相互作用网络图,探讨其可能调控的分子通路,以Human Protein Atlas数据库对转录因子进行蛋白表达定位,探 究其在神经系统和结肠的表达情况。采用实时荧光定量PCR方法,验证相关转录因子在30例HSCR患儿的狭窄段和扩张 段肠管标本中的表达差异。结果 用ChEA 3数据库对已报道的119个HSCR易感基因的转录因子预测及富集分析发现, FOXP2可以靶向作用于其中46个基因。在GeneMANIA数据库中分析显示FOXP2可能调控多个HSCR易感基因的表达, 与Hedgehog通路的GLI 3共表达,与PTCH1存在遗传相互作用。Human Protein Atlas数据库分析显示,FOXP2蛋白在脑神 经元细胞和结肠组织中高表达。30例HSCR患儿中位年龄为1岁,其中男23例、女7例,荧光定量PCR结果显示,FOXP 2 的mRNA表达量在病变组织较临近正常组织下降,差异有统计学意义(t= 5.819,P

来源:2021年第7期

《临床儿科》期刊编辑部

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